Escudo português, com o chefe superposto em prata (branco), contendo em si a sigla da Organização HFAG em sable (preto).
Campo terçado, estando à destra em blau (azul-cerúleo), onde figura o gládio alado em jalne (amarelo), símbolo do Ministério da Aeronáutica. À sinistra apresenta-se em sinopla (verde), tendo ao centro um gládio envolto por uma cobra, ambos em jalne (amarelo), simbolizando a missão médica do Hospital. Subpostas ao gladio, aparecem duas estrelas pentalfas frisadas em prata (branco), representando o posto de Brigadeiro, Diretor da Unidade.
O contrachefe aparece em blau (azul-ultramar), onde visualiza-se um Galeão em prata (branco), sobreposto à duas ondas no mesmo metal, sendo a embarcação associada a história dos primórdios da localidade onde situa-se o Hospital, ou seja, Ilha do Governador.
Contorna o escudo um filete em prata (branco) que se alarga em chefe, representando o nível de Direção da Organização – Oficial – General.
Estandarte terçado, estando o terço superior, próximo ao mastro, em blau (azul-cerúleo). O segundo terço apresenta-se em blau (azul-ultramar) e o terceiro em sinopla (verde).
Ao centro visualiza-se o emblema da Organização nos seus esmaltes.
Contorna o estandarte nos seus três bordos livres franjas em prata (branco), representando o nível de Direção da Organização – Oficial – General.
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